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上世纪90年代初，水母身上的一种绿色荧光蛋白给了钱永健灵感。他改造绿色荧光蛋白，通过改变其氨基酸排序，造出能吸收、发出不同颜色光的荧光蛋白，其中包括蓝色、*色、橙色、红色、紫色等。科研人员使用光学显微镜，就可轻松确认基因或蛋白质活动的时间和位置。通过给两种不同蛋白打上不同颜色的荧光标记，钱永健还找到监测两种蛋白质相互作用的方法。钱永健说：“整体而言，荧光蛋白对生物学许多领域产生巨大影响，因为它让科研人员把基因和他们所见到的细胞或器官内情况直接联系起来。”
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